【佳學(xué)基因檢測(cè)】基因解碼基因檢測(cè)揭示正常細(xì)胞抑制腫瘤的原因

腫瘤的基因檢測(cè)的位點(diǎn)從正常細(xì)胞的研究中獲得數(shù)據(jù)：

《腫瘤發(fā)生的分子物學(xué)基礎(chǔ)》清楚地闡述了MicroRNA（miRNA）在各種類型的癌癥中的表達(dá)調(diào)控異常。將其納入腫瘤基因正確用藥850中，在幅度提高腫瘤致病基因及靶向藥物發(fā)現(xiàn)的正確性。而且基于對(duì)MicroRNA的作用的基因解碼結(jié)果，另一種特殊的靶向藥物：反義寡核苷酸藥物被巧妙地設(shè)計(jì)出來(lái)，并被用于阻斷導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的腫瘤miR。但作為一種有效的抗癌策略，腫瘤抑制性miRNA的遞送具有巨大的潛力。《正常組織中的miRNA生理功能的基因解碼》的目的在于對(duì)于在各種類型的腫瘤中低表達(dá)但在多種正常組織中大量表達(dá)的miRNA的鑒定及功能分析。
 

如何分析正常組織和異常腫瘤組織中的miRNA的作用

從TCGA大數(shù)據(jù)中心選擇獲取14種癌癥類型的miRNA高通量、下一代測(cè)序（NGS)數(shù)據(jù)。使用limma軟件包（R編程）計(jì)算腫瘤和正常樣本之間miRNA表達(dá)的顯著差異。調(diào)整后的p值<0.05用于比較正常和腫瘤miRNA表達(dá)譜。使用TargetScan、miRanda和miRDB獲得預(yù)測(cè)的基因靶點(diǎn)，然后使用Enrichr進(jìn)行基因本體分析。只有調(diào)整后p<0.05的GO術(shù)語(yǔ)被認(rèn)為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。數(shù)據(jù)分析后所得的數(shù)據(jù)再通過(guò)細(xì)胞活力測(cè)定和流式細(xì)胞術(shù)等真實(shí)實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)的所有數(shù)據(jù)均以平均值±SEM表示，并使用GraphPad Prism軟件分析其差異（Student’s t檢驗(yàn)，p<0.05）。

從miRNA基因解碼中如何增加了可信賴的基因檢測(cè)位點(diǎn)

通過(guò)匯編來(lái)自癌癥基因組圖譜（TCGA）泛癌癥項(xiàng)目的所有公開(kāi)可用的miRNA圖譜數(shù)據(jù)，《腫瘤發(fā)生的分子物學(xué)基礎(chǔ)》發(fā)現(xiàn)了一小組腫瘤抑制miRNA（基因解碼稱之為“正常組分”），它們?cè)?4種正常組織中高度表達(dá)，但在相應(yīng)的腫瘤組織中低表達(dá)。有趣的是，肌肉組織中富有的miRNA（例如miR-133a/b和miR-206）和來(lái)自DLK1-DIO3位點(diǎn)的miRNA（例如miR-381和miR-411）構(gòu)成了正常組分的很大一部分。此外，《正常組織中的miRNA生理功能的基因解碼》明確了定義了CCCGU基序特異性基因序列在腫瘤miR的種子序列中缺失，但在一部分腫瘤抑制性miRNA中存在。賊后，候選正常組分在幾種癌細(xì)胞類型中的功能獲得表明，miR-206和miR-381在體外對(duì)多種癌細(xì)胞類型發(fā)揮賊有效的抑制作用。這些基因位點(diǎn)的突變成為佳學(xué)基因解碼高度推薦的腫瘤致病基因位點(diǎn)。它們到目前為止嘗未進(jìn)入大多數(shù)腫瘤致病基因鑒定基因檢測(cè)及腫瘤用藥指導(dǎo)基因檢測(cè)中。

《正常組織中的miRNA生理功能的基因解碼》研究結(jié)論：

發(fā)現(xiàn)了這是一組抑制腫瘤的miRNA，強(qiáng)調(diào)了它們具有針對(duì)多種腫瘤的miRNA替代療法的潛力。這些基因序列可以用來(lái)進(jìn)行腫瘤基因檢測(cè)，從而增加腫瘤發(fā)病原因的基因檢測(cè)及腫瘤正確用藥基因檢測(cè)的正確性。