【佳學(xué)基因檢測(cè)】ClinPharmSeq:用于臨床藥理學(xué)實(shí)施的靶向測(cè)序小組
根據(jù),國(guó)際有很高知名度基因檢測(cè)科學(xué)性證據(jù)雜志《》在第期發(fā)表了一篇標(biāo)題為《ClinPharmSeq:用于臨床藥理學(xué)實(shí)施的靶向測(cè)序小組》的文章。該基因領(lǐng)域的臨床應(yīng)用研究由Seung-Been Lee,?Jong-Yeon Shin,?Nak-Jung Kwon,?Changhoon Kim,?Jeong-Sun Seo??完成。
基因信息數(shù)據(jù)庫(kù)索引號(hào):
基因檢測(cè)人工智能數(shù)據(jù)標(biāo)簽:?35901010和?doi: 10.1371/journal.pone.0272129.?eCollection 2022.
基因解碼研究關(guān)鍵詞:
基因變異,藥物反應(yīng),不良反應(yīng),正確藥物治療,靶向測(cè)序,ClinPharmSeq
國(guó)際基因解碼證據(jù)鏈條標(biāo)簽:
genetic variants, drug response,adverse effects,precision drug therapy, Targeted sequencing,ClinPharmSeq
基因檢測(cè)臨床研究與應(yīng)用結(jié)果介紹:
正確識(shí)別導(dǎo)致治療藥物反應(yīng)或不良反應(yīng)的基因變異是實(shí)施正確藥物治療的先進(jìn)步。由于其在低成本、高通量和深度覆蓋之間的良好平衡,靶向測(cè)序基因檢測(cè)賊近已成為大規(guī)模遺傳變異研究的常用方法。在這里,基因解碼研究機(jī)構(gòu)展示了 ClinPharmSeq,這是一個(gè)包含 59 個(gè)與藥物遺傳學(xué) (PGx) 表型相關(guān)的基因的靶向測(cè)序基因檢測(cè)面板,作為探索藥物反應(yīng)與遺傳變異之間關(guān)系的平臺(tái),包括常見和罕見。為了驗(yàn)證,基因解碼研究機(jī)構(gòu)使用生物信息學(xué)工具 PyPGx 使用 ClinPharmSeq 對(duì)來(lái)自 64 個(gè)種族不同的 Coriell 樣本的 DNA 進(jìn)行測(cè)序基因檢測(cè),以調(diào)用 27 個(gè)基因中的星等位基因(單倍型模式)。這些參考樣本被多個(gè)實(shí)驗(yàn)室廣泛使用 PGx 檢測(cè)方法和賊近的全基因組測(cè)序基因檢測(cè)進(jìn)行了表征?;蚪獯a研究機(jī)構(gòu)發(fā)現(xiàn) ClinPharmSeq 可以始終如一地生成具有高一致性(30 倍或以上 = 94.8%)的深度覆蓋數(shù)據(jù)(平均值 = 274 倍)。基因解碼研究機(jī)構(gòu)的基因型分析從測(cè)序基因檢測(cè)數(shù)據(jù)中確定了總共 185 個(gè)獨(dú)特的星等位基因,并表明來(lái)自 ClinPharmSeq 的雙倍型調(diào)用與以前的出版物 (97.6%) 和全基因組測(cè)序基因檢測(cè) (97.9%) 高度一致。值得注意的是,所有 19 個(gè)具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異的星等位基因,包括基因缺失、重復(fù)和雜交,都以 100% 的正確率被召回??傊?,這些結(jié)果表明,ClinPharmSeq 平臺(tái)為廣泛實(shí)施 PGx 測(cè)試和優(yōu)化單個(gè)藥物治療提供了一條可行的途徑。
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