【佳學基因檢測】腦干神經瘤NF2基因檢測結果陰性是怎么找到致病基因突變的？ 

神經鞘瘤的基因檢測及靶向藥物治療概述

NF2 的雙等位基因失活代表了絕大多數神經鞘瘤的主要或少有致癌驅動基因突變。佳學基因神經外科腫瘤的基因解碼與基因檢測報告了一名 4 歲的女性患者，她接受了右側髓質實質內神經鞘瘤的次全切除術。RNA 測序發(fā)現存在YAP1的外顯子 5 和MAML2的外顯子 2之間的翻譯框內融合。YAP1-MAML2融合以前曾在多種腫瘤類型中發(fā)現過，但在神經鞘瘤中沒有記錄。神經外科腫瘤的基因解碼與基因檢測的報告擴大了致癌 YAP1 基因融合的范圍，成為 NF2 失活以外的致病基因突變，包括散發(fā)性神經鞘瘤，類似于賊近在 NF2 野生型兒科腦膜瘤中描述的情況?？紤]到潛在的腫瘤易感綜合征的高患病率，所有孤立性神經鞘瘤和腦膜瘤的年輕患者都應進行適當的體細胞和生殖系基因檢測檢測。在這些患者中，通過致病基因鑒定基因解碼發(fā)現一種體細胞非 NF2 致病基因突變，例如這種新描述的 YAP1 融合，可以幫助確定散發(fā)性神經鞘瘤的診斷。

神經鞘瘤的基因檢測及靶向藥物治療關鍵詞：

 神經鞘瘤,兒科,Mastermind,轉錄輔激活因子,MAML2,Yes1,轉錄調節(jié)因子,YAP1

神經鞘瘤的基因檢測及靶向藥物治療基本知識

神經鞘瘤是偶發(fā)性或在遺傳性腫瘤易感性的背景下出現的良性周圍神經鞘瘤；即2型神經纖維瘤?。∟F2）或神經鞘瘤病。NF2的雙等位基因失活是絕大多數神經鞘瘤的主要或少有致癌驅動基因突變；此外，SH3PXD2A-HTRA1融合也被基因解碼被確定為散發(fā)性神經鞘瘤亞型的替代致癌驅動因素。在新診斷的孤立性神經鞘瘤的兒科和年輕成人患者中，高達 30% 的人賊終將被診斷為遺傳性腫瘤易感綜合征，即 NF2 或較少見的神經鞘瘤病。然而，鑒于與假陰性種系檢測結果相關的鑲嵌現象的高流行率，正確確定種系狀態(tài)可能很困難 。

病例案例介紹

一名 4 歲女性接受了右側髓質神經鞘瘤的次全切除術。在進行性頭部傾斜的磁共振成像 (MRI) 上發(fā)現了腫瘤（圖 1）。既往病史因發(fā)育遲緩和面部不對稱（半面小兒）而顯著。在 18 個月大時進行的先前 MRI 顯示小腦發(fā)育不全，但沒有腫瘤。在佳學基因進行致病基因鑒定基因解碼前，采用的包括生殖系靶向基因檢測包基因檢測和全外顯子組測序在內的綜合臨床基因檢查結果為陰性。診斷后 8 個月的賊近一次腦部 MRI 隨訪顯示穩(wěn)定的殘留病灶。

圖1：T1 加權增強后（左圖）和 T2/FLAIR 加權（右圖）磁共振圖像顯示部分增強的實質內右側髓質腫瘤（箭頭）。腫瘤累及下腦橋右側、腦橋臂和小腦腹側

組織學檢查顯示腫瘤由緊密、交錯的束狀單形梭形細胞組成（圖2a)，沒有維羅凱氏體或 Antoni B 區(qū)域。缺乏有絲分裂活動，腫瘤細胞沿血管局部解剖成相鄰的神經實質。免疫組化研究表明，該病灶富含膠原蛋白 IV，腫瘤細胞 GFAP、EMA 和 SSTR2A 呈陰性，同時表達 S100 蛋白（細胞質/核）和 SOX10（細胞核）。

圖 2：腫瘤的蘇木精和伊紅染色 ( a ) 和 YAP1 的免疫組織化學 ( b )

使用 Heidelberg 腦腫瘤分類 11b6版本進行的DNA 甲基化分析顯示與甲基化類神經鞘瘤匹配，校準分數為 0.97。腫瘤和匹配的正常樣本的配對靶向二代測序分析結果表明體細胞突變和結構變異均呈陰性，并揭示了相對平坦的 DNA 拷貝數譜，在包括YAP1基因座在內的 11q 染色體上具有焦點基因組增加和丟失（如圖 3) 。使用錨定多重 PCR 的 RNA 測序揭示了YAP1的外顯子 5 和MAML2的外顯子 2之間的存在閱讀框內融合（圖  4）。在 NF2-野生型腦膜瘤 和其他癌癥中記錄了YAP1-MAML2融合，但在神經鞘瘤中在現有所有數據庫中沒有記錄。正如迄今為止記錄的所有 N 端 YAP1 融合中所見，在神經外科腫瘤的基因解碼與基因檢測的患者中檢測到的融合保留了 YAP1 的 TEAD 轉錄因子結合域，以及 MAML2 的核定位序列和反式激活域。由此產生的融合蛋白通過組成性核定位和對蛋白酶體降解的抗性對 Hippo 腫瘤抑制途徑的抑制性信號傳導具有抗性 。與這些觀察結果一致，神經外科腫瘤的基因解碼與基因檢測通過免疫組織化學證實了 YAP1 的強核定位，以及神經外科腫瘤的基因解碼與基因檢測患者腫瘤中較弱的細胞質標記（圖 2B）。

3：來自腫瘤和匹配正常樣本的配對靶向下一代測序分析的 DNA 拷貝數譜，揭示了相對平坦的 DNA 拷貝數譜，在包括 YAP1 在內的 11q 號染色體上具有焦點基因組增益（以紅色表示）和缺失（以藍色表示）軌跡。CNA：拷貝數改變

圖 4：使用錨定多重 PCR 的 RNA 測序揭示了 YAP1 的外顯子 5 和 MAML2 的外顯子 2 之間的框內融合

神經鞘瘤的致病基因突變及其正確診斷的分析及共識

神經外科腫瘤的基因解碼與基因檢測在 NF2 野生型神經鞘瘤中發(fā)現的致癌YAP1-MAML2融合支持這樣的觀點，即通過效應器 YAP/TAZ 的典型 Hippo 信號傳導是神經鞘瘤發(fā)生所必需的 。包括腦干神經鞘瘤在內的實質內神經鞘瘤是罕見的，并且在分子上沒有很好的特征 。

在患有孤立性神經鞘瘤或腦膜瘤的兒科和年輕成人患者中，分別高達 30% 和 50% 將具有可識別的遺傳易感性，賊常見的是 NF2 。因此，建議對所有孤立性神經鞘瘤或腦膜瘤的年輕患者進行適當的臨床篩查檢查和腫瘤和生殖系的分子遺傳學檢測。然而，由于嵌合體的高患病率，在生殖系檢測陰性的患者中很難排除 NF2 或神經鞘瘤病的診斷 。在此類患者中，識別出體細胞非 NF2 驅動改變，例如YAP1融合，可以幫助確定散發(fā)性神經鞘瘤或腦膜瘤的診斷信心，并且可能不需要進一步的基因或臨床測試來排除遺傳性腫瘤易感性綜合征。

《人體基因序列變化與疾病表征》中縮寫字母的文字解釋