【佳學(xué)基因檢測(cè)】視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)TOP10

基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)介紹：

基因檢測(cè)單位名稱(chēng)：江西省吉安市基因檢測(cè)服務(wù)中心。其他成熟基因檢測(cè)項(xiàng)目：特異性抗多糖抗體缺乏地貧基因檢測(cè)結(jié)果分析, 3-甲基戊烯二酸尿癥基因檢查機(jī)構(gòu)的選擇標(biāo)準(zhǔn)是什么？。視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤是賊早展示了RB1基因的腫瘤抑制作用的腫瘤之一?，F(xiàn)代突變研究廣泛深入,RB1基因是導(dǎo)致這種疾病的主要基因。理解視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的分子遺傳學(xué)對(duì)于診斷和預(yù)后至關(guān)重要。RB的分子診斷是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程,高通量技術(shù)可以為之做出重大貢獻(xiàn)。基因解碼表明,除了RB1突變外,還有其他基因參與其中,主要是MYCN,其擴(kuò)增發(fā)現(xiàn)于未發(fā)生RB1失活的患者中。在一小部分腫瘤中也發(fā)現(xiàn)了BCOR和CREBBP基因的重復(fù)突變。此外,表觀遺傳變化也有助于視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的進(jìn)展,表明pRB蛋白在染色質(zhì)重塑中發(fā)揮重要作用。這些發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致了對(duì)視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤亞型的分類(lèi)提議。使用cfDNA和tfDNA是另一種有望改善受影響兒童治療方案和結(jié)果的新方法。通過(guò)眼前節(jié)的tfDNA可以接觸腫瘤基因組,這是診斷的一個(gè)非常有用的DNA來(lái)源,可以幫助預(yù)測(cè)哪些眼睛可以被挽救。佳學(xué)基因規(guī)劃中的基因解碼包括確定可信的生物標(biāo)記物和分子靶點(diǎn),以改善診斷和治療選擇。

基因檢測(cè)導(dǎo)讀：

視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤基因研究進(jìn)展: 來(lái)自甘肅省酒泉市金塔縣三合鄉(xiāng)的繆珍亦（化名）在川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院被醫(yī)生診斷為視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤。歸納《Journal of Hematology and Oncology》,基因突變引起的視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤會(huì)遺傳。

本文關(guān)鍵詞

視網(wǎng)膜,母,細(xì)胞,瘤,基因檢測(cè)

人體疾病表征數(shù)據(jù)庫(kù)查詢

產(chǎn)生視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤醫(yī)師會(huì)懷疑以下疾病類(lèi)型：視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤是一種起源于胚胎視網(wǎng)膜細(xì)胞的惡性腫瘤，其臨床表現(xiàn)復(fù)雜多樣，包括結(jié)膜內(nèi)充血、水腫、角膜水腫、虹膜新生血管、玻璃體混濁、眼壓升高及斜視等。在診斷視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤時(shí)，需要與其他一些具有相似或重疊臨床表現(xiàn)的疾病進(jìn)行鑒別。以下是一些與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤有相同、相似或重疊表現(xiàn)的疾病： Coats病：也稱(chēng)為視網(wǎng)膜毛細(xì)血管擴(kuò)張癥，其好發(fā)于健康男童，并在10歲前發(fā)病。該病可表現(xiàn)為斜視和白瞳癥，這些癥狀與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤相似。因此，在診斷過(guò)程中需要對(duì)這兩種疾病進(jìn)行鑒別。 轉(zhuǎn)移性眼內(nèi)炎：這種疾病多見(jiàn)于兒童高熱病后，病原體通過(guò)血液循環(huán)到達(dá)眼內(nèi)。其癥狀包括患眼前房和玻璃體內(nèi)大量滲出，形成玻璃體膿腫，瞳孔呈黃白色，也可能表現(xiàn)為白瞳癥。這些表現(xiàn)與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的癥狀有重疊之處。 早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變：雖然其發(fā)病機(jī)制和病理特點(diǎn)與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤不同，但某些臨床表現(xiàn)可能與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤相似。因此，在診斷過(guò)程中也需要考慮這種可能性。 其他眼部腫瘤：如葡萄膜黑色素瘤、視網(wǎng)膜血管瘤等，這些腫瘤也可能引起眼部充血、水腫、玻璃體混濁等癥狀，與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的表現(xiàn)相似。 需要注意的是，雖然這些疾病可能與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤有相似的癥狀或體征，但它們的病理生理機(jī)制、治療方法和預(yù)后都有所不同。因此，在出現(xiàn)相關(guān)癥狀時(shí)，應(yīng)盡早就醫(yī)并進(jìn)行詳細(xì)的醫(yī)學(xué)檢查，包括眼科檢查、影像學(xué)檢查等，以便正確診斷并制定合適的治療方案。醫(yī)生會(huì)根據(jù)患者的病史、臨床表現(xiàn)和檢查結(jié)果進(jìn)行綜合判斷，以確診疾病并制定相應(yīng)的治療方案。

怎樣才能診斷正確？

表型數(shù)據(jù)庫(kù)代碼是：HP:0009919

基因解碼基因檢測(cè)為什么更正確？

基因解碼表明，除了非編碼RNA的參與外,其他表觀遺傳機(jī)制也被發(fā)現(xiàn)是導(dǎo)致視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤病因的原因。視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤細(xì)胞的全基因組甲基化分析提供了新的見(jiàn)解,即表觀遺傳變化有助于促進(jìn)視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的生長(zhǎng)和進(jìn)展?；蚪獯a表明,腫瘤促進(jìn)通路的表觀遺傳失調(diào)對(duì)于視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的形成和進(jìn)展至關(guān)重要,這超出了RB1失活的范疇。這表明表觀遺傳藍(lán)圖也可能作為預(yù)測(cè)性分子生物標(biāo)記。視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤DNA甲基化譜的預(yù)后價(jià)值并非每一個(gè)醫(yī)生或者是檢驗(yàn)機(jī)構(gòu)都了解。

視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤包括由于許多相關(guān)基因的啟動(dòng)子發(fā)生異常甲基化而導(dǎo)致的改變。不用說(shuō),首先被研究DNA甲基化的基因之一就是RB1基因。RB1基因的5'區(qū)域含有一個(gè)CpG島,涵蓋了通常未甲基化的關(guān)鍵啟動(dòng)子區(qū)域。RB1啟動(dòng)子DNA的過(guò)度甲基化是導(dǎo)致散發(fā)性視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的已知原因,并與pRB1蛋白表達(dá)降低相關(guān)。RB1基因的過(guò)度甲基化發(fā)生在13%的散發(fā)性單側(cè)腫瘤中,并且報(bào)告顯示特異性甲基化的是父代等位基因?；蚪獯a者進(jìn)行了基因組尺度的DNA甲基化分析,以確定視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤腫瘤的甲基化狀態(tài)。他們發(fā)現(xiàn)有294個(gè)基因直接受啟動(dòng)子或基因體DNA甲基化調(diào)控。視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤研究也調(diào)查了其他基因的甲基化狀態(tài)。一些發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子發(fā)生異常甲基化的基因包括MGMT、RASSF1A、CASP8、MLH1基因、CDKN2A/p16INK4A、VHL、LDHA、RUNX3、APC2、PAX5和許多其他基因。例如,RASSF1A在59%的視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤腫瘤中發(fā)生過(guò)度甲基化,APC在6%中發(fā)生,而MGMT在所分析的15%視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤中發(fā)生?；蚪獯a還分析了一種組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶,這是一種特異于視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤并在腫瘤中過(guò)度表達(dá)的酶蛋白。這就是增強(qiáng)子zeste 2polyomb抑制復(fù)合物2亞基基因(EZH2)。 

啟動(dòng)子的甲基化狀態(tài)和伴隨的體細(xì)胞突變改變共同定義了視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的侵襲性。

不同的omics技術(shù)揭示了參與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤病因?qū)W的更多基因。這成為基因解碼基因檢測(cè)具有更高的正確性和檢出離的基礎(chǔ)。使用單細(xì)胞RNA測(cè)序,發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)移患者的視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤組織中UBE2C(一種促進(jìn)生長(zhǎng)和增殖的癌基因)的表達(dá)水平顯著升高。在視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤中發(fā)現(xiàn)上調(diào)和過(guò)度表達(dá)的基因是NEK7和SKP2,而RNA測(cè)序分析顯示ARHGAP9和DRAIC的表達(dá)水平顯著降低。值得注意的是,發(fā)現(xiàn)ARHGAP9的降低水平顯著影響了對(duì)化療藥物的敏感性。全外顯子組測(cè)序、體細(xì)胞拷貝數(shù)變異分析、微陣列分析等集體揭示了DEK、CRB1、MIR181、NUP205、IL8、IL6、MYC和SMAD3這些在視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤中過(guò)度表達(dá)并且通常與侵襲性視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤相關(guān)的其他候選基因。Memorial Sloan Kettering開(kāi)發(fā)的一種腫瘤分型檢測(cè)——可行動(dòng)癌癥靶向整合突變分型,揭示了下調(diào)的基因,即CREBBP、HIST1H4H、RELN、RPTOR、TERT、MSH3、TSC2、ARID1A、CDK4、BRAF、JAK1和ROCK1。另一種方法——視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤腫瘤的蛋白質(zhì)組學(xué)分析也被基因解碼用于分析測(cè)序結(jié)果,提供了參與其中的其他相關(guān)蛋白產(chǎn)物。觀察到IGF2BP1、SOX4和B7H3蛋白的上調(diào)表達(dá)。此外,發(fā)現(xiàn)鉻素A、Rac GTPase激活蛋白1、載體A、中激肽、LRP1、COMP、TGB3、TLN、FLNA、OGN、A1BG、血漿蛋白酶抑制劑A1、ORM2、LRG1、CHI3L1、載脂蛋白A1、轉(zhuǎn)鐵蛋白、A型晶體蛋白和CRABP2蛋白也發(fā)生了上調(diào)。相反,質(zhì)譜分析顯示,PEDF和核素蛋白(NCL)的蛋白水平在視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤中下調(diào)。

表觀遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),SKY蛋白水平發(fā)生表觀遺傳上調(diào),此外,發(fā)現(xiàn)DNMT1a和DNMT3a蛋白的高表達(dá)也特別與惡性表型相關(guān)。HELLS蛋白表達(dá)下調(diào),而PLK1則上調(diào)[52]。同樣,通過(guò)視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤腫瘤的生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn) MGMT、CDK1、BUB1、CCNB2、CCNB1、TOP2A、RRM2、KIF11、KIF20A、NDC80 和 TTK 基因發(fā)生表觀遺傳沉默,這與不良的生存結(jié)果相關(guān)。在液相色譜-質(zhì)譜的幫助下,發(fā)現(xiàn)了高磷酸化的蛋白,包括應(yīng)激反應(yīng)蛋白H2AFX和SIRT1以及蛋白激酶BRD4、WNK1和CDK1。

基因解碼使用甲基化特異性多重連接探針?lè)治龇▓?bào)告了新基因T3A、MSH6、CD44、PAX5、GATA5、TP53、VHL和GSTP1的過(guò)度甲基化,他們還證實(shí)了已知的MGMT、RB1和CDKN2過(guò)度甲基化。從而進(jìn)一步提高了正確率和檢出率。