【佳學(xué)基因檢測(cè)】16S rRNA基因循環(huán)測(cè)序在臨床微生物實(shí)驗(yàn)室常規(guī)細(xì)菌鑒定中的性能及應(yīng)用
腫瘤基因檢測(cè)的費(fèi)用大概多少錢引言
研究癌癥的早期發(fā)現(xiàn)及檢測(cè)獲悉《Front Bioeng Biotechnol》在?2021; 9: 787551發(fā)表了一篇題目為《16S rRNA基因循環(huán)測(cè)序在臨床微生物實(shí)驗(yàn)室常規(guī)細(xì)菌鑒定中的性能及應(yīng)用》腫瘤靶向藥物治療基因檢測(cè)臨床研究文章。該研究由Tine Tesovnik,? , Barbara Jenko Bizjan,? Robert ?ket,? Maru?a Debeljak,? Tadej Battelino,? ,? and Jernej Kova?? ,等完成。促進(jìn)了腫瘤的正確治療與個(gè)性化用藥的發(fā)展,進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了基因信息檢測(cè)與分析的重要性。
腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究?jī)?nèi)容關(guān)鍵詞:
16S rRNA,細(xì)菌,循環(huán)測(cè)序,鑒別。
腫瘤靶向治療基因檢測(cè)臨床應(yīng)用結(jié)果
這篇綜述提供了對(duì) 16S rRNA 基因 Sanger 循環(huán)測(cè)序性能的賊新描述,用于臨床微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中細(xì)菌的常規(guī)鑒定。概述了技術(shù)和當(dāng)前方法的詳細(xì)描述,主要關(guān)注正確的數(shù)據(jù)分析和序列解釋。本文的其余部分側(cè)重于基于對(duì) 16S 多比對(duì)序列的分析,對(duì)該方法在細(xì)菌病原體鑒定中的應(yīng)用進(jìn)行綜合評(píng)估。特別是,強(qiáng)調(diào)了 16S 內(nèi)對(duì)臨床相關(guān)病原體的屬和種水平區(qū)分的現(xiàn)有相似性限制,以及公共數(shù)據(jù)庫(kù)中目前缺乏序列數(shù)據(jù)。描述了一項(xiàng)大型區(qū)域臨床微生物學(xué)服務(wù)的多年經(jīng)驗(yàn),該服務(wù)采用直接 16S 廣譜 PCR,然后進(jìn)行循環(huán)測(cè)序,以直接檢測(cè)適當(dāng)臨床樣本中的病原體。比較了蛋白質(zhì)組學(xué)(基質(zhì)輔助解吸電離-飛行時(shí)間)與 16S 測(cè)序在細(xì)菌鑒定和基因分型方面的能力。賊后,提出了通過(guò)下一代測(cè)序 (NGS) 進(jìn)行全基因組分析以替代 16S 測(cè)序用于常規(guī)診斷的潛力,用于多種應(yīng)用,包括在臨床微生物學(xué)中全面實(shí)施更新的基因組方法必須克服的障礙。大型臨床、參考和研究實(shí)驗(yàn)室以及工業(yè)界未來(lái)面臨的挑戰(zhàn)是將大量積累的 NGS 微生物數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為適用于各種應(yīng)用(即微生物鑒定、基因分型和宏基因組學(xué)和微生物組分析),以便以易于理解和可操作的格式向醫(yī)生報(bào)告臨床相關(guān)信息。這些挑戰(zhàn)將不僅僅由臨床微生物學(xué)家面臨,而是由每一位參與到基因和基因序列的自然多樣性在疾病、健康、致病性、流行病學(xué)和生命形式的其他方面發(fā)揮關(guān)鍵作用的領(lǐng)域的科學(xué)家所面臨。克服這些挑戰(zhàn)將需要跨通常不與臨床領(lǐng)域相互作用的領(lǐng)域的全球多學(xué)科努力,以使大量測(cè)序數(shù)據(jù)在臨床上可解釋和可操作。關(guān)鍵詞:16S rRNA;細(xì)菌;循環(huán)測(cè)序;鑒別。
腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)描述:
16S rRNA; bacteria; cycle sequencing; identification.
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)