CIViC數(shù)據(jù)平臺的全稱
CIViC數(shù)據(jù)平臺的全稱是:Clinical Interpretation of Variants in Cancer。翻譯成中文就是癌癥基因序列變化的臨床解釋。CIViC是一個由腫瘤基因解碼專家共同搭建的一個開放的網(wǎng)絡(luò)平臺。
為什么要建立CIViC網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺?
正確醫(yī)學(xué)是指根據(jù)每個個體及其疾病的獨(dú)特特點(diǎn),來選擇和設(shè)計(jì)預(yù)防、干預(yù)和治療策略。對于癌癥來說,不同的癌癥患者個有不同的腫瘤驅(qū)動基因,有不同的突變組合,每一個患者可能因?yàn)榇嬖谔囟ǖ耐蛔?,從而對?療藥物及靶向藥物存在著不同的的反應(yīng),從面產(chǎn)生不同的治療效果。由于關(guān)于腫瘤的基因解碼研究快速發(fā)展,而基因檢測結(jié)果的正確與否、以及如何選擇更更多的基因位點(diǎn)進(jìn)行檢測需要依賴對各種突變序列的解釋。但是由于研究文獻(xiàn)雜亂而分散,而且研究和分析結(jié)果主要存在于各個機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫中,從而浪費(fèi)大量的人力、物力,做著重復(fù)性的工作。建立CIViC平臺的目的,就是集中基因信息解碼生態(tài)圈的資源,共同對癌癥中的基因序列變化進(jìn)行注釋、討論、和應(yīng)用。并且通過這個平臺傳播基因?qū)Π┌Y的發(fā)生、治療的知識。推進(jìn)正確醫(yī)學(xué)的發(fā)展。
如何訪問CIViC網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺?
截至到2020年2月:CIViC平臺的網(wǎng)址是:https://civicdb.org/about。 大家點(diǎn)擊鏈接即可訪問這一公開網(wǎng)絡(luò)資源。
參與CIViC網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺的都有哪些牛人?
使用CIViC平臺的都有哪些機(jī)構(gòu)?
目前使用CIViC數(shù)據(jù)平臺有有很多全球性的大公司和國際知名研究機(jī)構(gòu)。
- Agilent's Alissa Clinical Informatics Platform
- Biogazelle
- BioGPS
- Cambridgene
- CancerStop Android Application
- CBioPortal
- CIViCmine
- DAPHNI – A platform for precision medicine of multiple myeloma
- Database of Curated Mutations (DoCM)
- ETH Nexus Personalized Health Technologies - Swiss Variant Interpretation Platform for Oncology
- Euformatics OmnomicsNGS
- Gemini
- Gene Cards
- Genoox
- GoldenHelix - VSClinical
- Google BigQuery
- International Cancer Genome Consortium (ICGC) Data Portal
- LifeMap Sciences TGex NGS Analysis & Interpretation Platform
- Medical Genomics Japan Variant Database (MGeND)
- Microsoft Research - Natural Language Processing
- MolecularMatch
- Monarch Initiative (via Wikidata)
- My Variant Info
- Monarch Iniative SEPIO - Scientific Evidence and Provenance Information Ontology
- NDEx - The Network Data Exchange
- OncoMX
- PathOS - Peter MacCallum Cancer Centre
- PDX Finder
- Smart Cancer Navigator
- SoftGenetics - Geneticist Assistant NGS Interpretative Workbench
- SolveBio
- TCGA Next-Gen Clustered Heat Map Compendium
- The Hyve
- UCSC Genome Browser (My Data -> Track Hubs -> Cancer Genomics Tracks)
- Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
- VarSome
- Wikidata
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