【佳學(xué)基因檢測(cè)】科研服務(wù)：GWAS基因檢測(cè)分析中的位點(diǎn)遺傳性分析

佳學(xué)基因采用具有自主研發(fā)的LD評(píng)分回歸軟件系統(tǒng)進(jìn)評(píng)估GWAS中發(fā)現(xiàn)的基因位點(diǎn)可遺傳性。建立了LD分級(jí)評(píng)估系統(tǒng)。使用來(lái)自1000基因組項(xiàng)目歐洲血統(tǒng)的個(gè)體計(jì)算每個(gè)SNP的LD分?jǐn)?shù)。我們將分析限制在分型良好的SNPs，過(guò)濾到HapMap3 SNPs，MAF高于1%。經(jīng)過(guò)去除INDEL、結(jié)構(gòu)變異、鏈模糊SNPs和效應(yīng)大小非常大的SNPs（χ2） > 80). 通過(guò)考慮人群患病率（4%）和樣本患病率（21%）的差異，通過(guò)遺傳因素評(píng)估系統(tǒng)來(lái)計(jì)算遺傳性。人口患病率來(lái)自2018年全國(guó)藥物使用和健康調(diào)查。

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