【佳學(xué)基因-基因檢測(cè)】什么是全外顯子組測(cè)序?
全外顯子組測(cè)序,簡稱全外顯子測(cè)序。這個(gè)概念或者是名詞主要是用來定義高通量測(cè)序的范圍。使用該名詞,如果有效按照技術(shù)指標(biāo),它應(yīng)當(dāng)是對(duì)一個(gè)基因組的全部外顯子的基因序列進(jìn)行獲取。它是在兒科基因檢測(cè)、罕見病基因檢測(cè)、致病基因鑒定過程中的一個(gè)測(cè)序質(zhì)量要求。應(yīng)當(dāng)注意的是全外顯子測(cè)序或者全外顯子測(cè)序本身不能找疾病發(fā)生的原因。它還需要接合其他基因技術(shù)。我們首先來介紹一下外顯子測(cè)序技術(shù)。全外顯子組測(cè)序哪里做?
首先了解下外顯子,它是真核生物基因的一部分,在轉(zhuǎn)錄過程中發(fā)生剪接(Splicing)后仍會(huì)被保存下來,并可在蛋白質(zhì)生物合成過程中被表達(dá)為蛋白質(zhì)。全外顯子組則是所有外顯子序列的合集。當(dāng)存在影響蛋白結(jié)構(gòu)的變異時(shí),全外顯子測(cè)序就利用目標(biāo)序列捕獲技術(shù)對(duì)蛋白編碼序列進(jìn)行高通量測(cè)序,找出結(jié)構(gòu)變異。全外顯子測(cè)序技術(shù)?
人類基因中大約有180,000外顯子,占人類基因組的1%,約30MB。相比于人類全基因組重測(cè)序,全外顯子組測(cè)序成本低,效率高,尤其是對(duì)已知的單基因病的研究,同時(shí)對(duì)于復(fù)雜疾病及癌癥等的致病基因和易感基因的確定也有廣泛應(yīng)用。擴(kuò)展全外顯子組測(cè)序的價(jià)格?
既然如此,那么只用全外顯子測(cè)序來檢測(cè)基因突變,尋找治病原因豈不是經(jīng)濟(jì)又高效?全外顯子測(cè)序是對(duì)具有蛋白編碼功能的外顯子進(jìn)行的測(cè)序技術(shù),也就是說它檢測(cè)的是編碼蛋白質(zhì)部分的基因的突變情況。人們研究發(fā)現(xiàn),對(duì)于單核苷酸突變(SNV)和小片段插入/缺失突變(indel)檢測(cè),全外顯子測(cè)序結(jié)果和全基因組測(cè)序結(jié)果是相近的,只不過全基因組測(cè)序結(jié)果相對(duì)質(zhì)量高且均一;至于拷貝數(shù)變異(cnv)以及染色體結(jié)構(gòu)變異(sv),全外顯子組測(cè)序就沒有全基因組測(cè)序那么高效了。全外顯子組測(cè)序哪里做?
雖然目前全外顯子測(cè)序依靠著經(jīng)濟(jì)、正確高效的優(yōu)勢(shì)被青睞,但全基因組測(cè)序在檢測(cè)導(dǎo)致疾病發(fā)生的潛在基因突變方面更加強(qiáng)大。隨著測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展以及全基因組測(cè)序成本的降低,在將來的科學(xué)研究和臨床醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域,綜合利用全基因組測(cè)序和全外顯子測(cè)序的方法,對(duì)重大疾病以及腫瘤的致病機(jī)制和正確治療方面將會(huì)有著廣闊前景。醫(yī)學(xué)全外顯子組測(cè)序哪里做?
全外顯子測(cè)度需檢區(qū)別于檢測(cè)包,基因檢測(cè)panel.html">PANEL、基因檢測(cè)大PANLE、基因測(cè)序PANEL。全外顯子測(cè)序是致病基因鑒定基因解碼對(duì)測(cè)序的基本要求,致病基因鑒定基因解碼的出發(fā)點(diǎn)是通過一次檢測(cè),增大獲得、找到突變基因、明確基因原因的可能性。而檢測(cè)包或者是檢測(cè)PANEL則是人為地、主觀選擇部分基因序列,在選擇基因范圍內(nèi)查找導(dǎo)致疾病發(fā)生的原因。因此,在很多情況下,采用基因檢測(cè)包、基因檢測(cè)PANEL檢測(cè)結(jié)果是陰性的時(shí)候,還需再做基于全外顯測(cè)序的致病基因鑒定基因解碼。醫(yī)學(xué)全外顯子組測(cè)序哪里做?