【佳學(xué)基因檢測】PI4KA相關(guān)疾病基因檢測
概括
臨床特征
PI4KA相關(guān)疾病是一種臨床多變疾病,其主要特征是神經(jīng)功能障礙(肢體痙攣、發(fā)育遲緩、智力障礙、癲癇發(fā)作、共濟失調(diào)、眼球震顫)、胃腸道表現(xiàn)(多發(fā)性腸閉鎖、炎癥性腸病)和聯(lián)合免疫缺陷(白細胞減少癥、多發(fā)性免疫球蛋白缺陷)。發(fā)病年齡通常是產(chǎn)前或兒童早期;個人可以呈現(xiàn)這些特征的任意組合。罕見的個體出現(xiàn)遲發(fā)性遺傳性痙攣性截癱。腦部 MRI 發(fā)現(xiàn)可能包括髓鞘化性腦白質(zhì)營養(yǎng)不良、小腦發(fā)育不全/萎縮、胼胝體薄或發(fā)育不良和/或外側(cè)裂多小腦回。
診斷/測試
PI4KA相關(guān)疾病的診斷建立在先證者具有特征性特征和通過分子遺傳學(xué)檢測鑒定的雙等位基因 PI4KA致病變異體中。
管理
治療:多學(xué)科團隊的個性化護理;肢體痙攣和運動問題所需的物理治療、職業(yè)治療、助行器和醫(yī)療管理;語言障礙和/或吞咽困難的語言治療;根據(jù)需要提供交流輔助工具;對智力殘疾的教育支持;癲癇發(fā)作所需的抗癲癇藥物;根據(jù)喂養(yǎng)問題進行胃造口術(shù);每個外科醫(yī)生和胃腸病學(xué)家治療多發(fā)性腸閉鎖和炎癥性腸??;每個免疫學(xué)家的免疫缺陷治療;聽力和視力問題的標準治療。
監(jiān)測:每年或根據(jù)需要進行神經(jīng)、發(fā)育和胃腸道評估;每年考慮全血細胞計數(shù)和炎癥標志物或根據(jù)癥狀學(xué)指示;根據(jù)需要進行內(nèi)窺鏡檢查;監(jiān)測感染易感性的增加;整個童年時期的年度聽力學(xué)和眼科評估。
遺傳咨詢
PI4KA相關(guān)疾病以常染色體隱性方式遺傳。如果已知父母雙方都是PI4KA致病性變異的雜合子,則受影響個體的每個同胞在受孕時有 25% 的機會受到影響,有 50% 的機會成為無癥狀攜帶者,并且有 25% 的機會不遺傳任何一個家族性致病變異。一旦在受影響的家庭成員中鑒定出PI4KA致病變異,就可以對有風(fēng)險的親屬進行攜帶者檢測以及產(chǎn)前和植入前基因檢測。
基因?qū)彶榉秶?/span>
診斷
建議性發(fā)現(xiàn)
PI4KA相關(guān)疾病是一種臨床多變的疾病,其特征是神經(jīng)功能障礙、胃腸道表現(xiàn)(腸閉鎖、炎癥性腸病)和免疫缺陷。具有以下臨床、實驗室和影像學(xué)特征的個體應(yīng)懷疑PI4KA相關(guān)疾病。
臨床表現(xiàn)
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神經(jīng)病學(xué)
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外周痙攣,通常在下肢比上肢更明顯
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軀干張力減退
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全球發(fā)育遲緩
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智力障礙(輕度至重度)
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癲癇發(fā)作
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共濟失調(diào)
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眼球震顫
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意向性震顫
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運動障礙
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肌張力障礙
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關(guān)節(jié)彎曲/攣縮
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脊柱后凸或脊柱側(cè)彎
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胃腸道
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多發(fā)性腸閉鎖
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極早發(fā)或難治性炎癥性腸病
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非特異性胃腸道癥狀(嘔吐、腹瀉、便秘、胃食管反流?。?/span>
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聯(lián)合免疫缺陷。反復(fù)性中耳炎;上呼吸道和下呼吸道感染
實驗室特點
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糞便鈣衛(wèi)蛋白升高
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缺鐵性貧血
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C反應(yīng)蛋白增加
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低丙種球蛋白血癥:可變的免疫球蛋白缺陷
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白細胞減少癥:細胞缺陷,從嚴重的 T 細胞淋巴細胞減少(影響 CD8+ T 細胞多于 CD4+ T 細胞)、中度 B 和 NK 細胞淋巴細胞減少到正常的淋巴細胞計數(shù)
成像功能
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腦部核磁共振。以異常白質(zhì)信號(彌漫性 T 2加權(quán)白質(zhì)信號升高,通常涉及整個幕上白質(zhì))為特征的低髓鞘質(zhì)白質(zhì)營養(yǎng)不良,通常與胼胝體薄、小腦發(fā)育不全或萎縮、進行性幕上萎縮、腦干萎縮(腦橋和延髓),和/或多小腦回
注意:迄今為止,僅在具有PI4KA基因突變 p.Asp1854Asn 的個體中報道了 Perisylvian 多 小腦回。 -
胃腸成像。小腸和/或結(jié)腸的腸閉鎖可能很廣泛,影響從幽門到肛門的胃腸道。
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胃腸內(nèi)鏡和組織病理學(xué)特征。注意到多個異常,包括多個不同的小管腔,內(nèi)襯粘膜和周圍的肌層粘膜,管腔擴張和變窄,有粘膜萎縮區(qū)域和急性中性粒細胞粘膜炎癥病灶。炎癥性腸病患者的內(nèi)鏡和組織學(xué)檢查結(jié)果包括淋巴黏膜浸潤;上皮損傷、回腸/一般結(jié)腸炎癥;克羅恩病、潰瘍性結(jié)腸炎或未特指的炎癥性腸病的組織學(xué)特征。
家族史符合常染色體隱性遺傳(例如,受影響的同胞和/或父母血緣關(guān)系)。沒有已知的家族史并不排除診斷。
建立診斷
PI4KA相關(guān)疾病的診斷建立在先證者具有提示性臨床特征、腦 MRI 特征和/或腸道組織學(xué),以及通過分子遺傳學(xué)檢測鑒定的PI4KA 雙等位基因致?。ɑ蚩赡苤虏。┳儺悾ㄒ姳?1)。
注意:(1) 根據(jù) ACMG 變異解釋指南,術(shù)語“致病變異”和“可能的致病變異”在臨床環(huán)境中是同義詞,這意味著兩者都被認為是診斷性的,都可以用于臨床決策。本節(jié)中提及的“致病性變異”應(yīng)理解為包括任何可能的致病性變異。(2) 鑒定意義不確定的雙等位基因 PI4KA基因突變(或鑒定一種已知的PI4KA致病性基因突變和一種意義不確定的PI4KA基因突變)不能確定或排除該疾病的診斷。(3) PI4KA的遺傳分析 由于兩個未處理的假基因部分拷貝PI4KAP1和PI4KAP2的存在而變得復(fù)雜,每個拷貝都位于距 PI4KA <1 Mb 的位置。
分子遺傳學(xué)檢測方法可以包括基因靶向檢測(單基因檢測或多基因檢測)和綜合 基因組檢測(外顯子組測序、基因組測序)的組合,具體取決于表型。
基因靶向檢測要求臨床醫(yī)生確定可能涉及哪些基因,而基因組檢測則不然。具有提示性發(fā)現(xiàn)中描述的獨特發(fā)現(xiàn)的個體很可能使用基因靶向檢測進行診斷(參見選項 1),而具有與許多其他神經(jīng)發(fā)育障礙無法區(qū)分的表型的個體更有可能使用基因組檢測進行診斷(參見選項 2) .
選項1
當表型發(fā)現(xiàn)提示PI4KA相關(guān)疾病的診斷時,分子遺傳學(xué)檢測方法可以包括單基因檢測或使用多基因組。
-
單基因檢測。首先進行PI4KA的序列分析 以檢測小的基因內(nèi)缺失/插入和 錯義、 無義和 剪接位點基因突變。通常情況下,如果使用的測序方法僅檢測到一個基因突變或沒有檢測到變異,下一步是進行基因靶向 缺失/重復(fù)分析,以檢測 外顯子和全基因缺失或重復(fù);然而迄今為止, PI4KA沒有刪除或重復(fù)已被確定為這種疾病的原因。
注意:對于已知的 致病性基因突變 c.4867T>G (p.Tyr1623Asp)的靶向分析可以首先在阿米什血統(tǒng)的個體中進行,這些個體出生時患有多發(fā)性腸閉鎖,有或沒有免疫缺陷。 -
一個包含 PI4KA和其他感興趣基因的多基因組(參見 鑒別診斷)賊有可能識別該病癥的遺傳原因,同時限制對 無法解釋潛在 表型的基因中具有不確定意義的變異和致病變異的識別。注:(1)panel中包含的基因以及 每個 基因所用檢測的診斷敏感性因?qū)嶒炇叶?,并且可能會隨著時間而改變。(2) 一些多基因組合可能包含與本 GeneReview中討論的疾病無關(guān)的基因。(3) 在一些實驗室中,panel 選項可能包括定制的實驗室設(shè)計的panel和/或定制的以表型為中心的 外顯子組分析,其中包括臨床醫(yī)生指定的基因。(4) panel 中使用的方法可能包括 序列分析、 缺失/重復(fù)分析和/或其他非基于測序的測試。
有關(guān)多基因面板的介紹,請單擊 此處??梢栽?此處找到有關(guān)訂購基因檢測的臨床醫(yī)生的更多詳細信息。
選項 2
全面的 基因組測試不需要臨床醫(yī)生確定可能涉及哪個基因。外顯子組測序是賊常用的;基因組測序也是可能的。
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表格1用于PI4KA 相關(guān)疾病的分子遺傳學(xué)檢測
1.
參見表A.染色體 位點和蛋白質(zhì)的基因和數(shù)據(jù)庫。
2.
有關(guān)在該基因中檢測到的變異的信息,請參閱分子遺傳學(xué)。
3.
序列分析檢測良性、可能良性、意義不確定、可能致病或致病的變異。變異可能包括小的基因內(nèi)缺失/插入和錯義、無義和剪接位點變異;通常,不會檢測到外顯子或全基因缺失/重復(fù)。有關(guān)序列分析結(jié)果解釋中需要考慮的問題,請在本文上方的搜索框中搜索查詢。
4.
數(shù)據(jù)來源于人類基因突變數(shù)據(jù)庫的基于訂閱的專業(yè)觀點
5.
基因靶向缺失/重復(fù)分析檢測基因內(nèi)缺失或重復(fù)。使用的方法可以包括一系列技術(shù),例如定量 PCR、長程 PCR、多重連接依賴探針擴增 (MLPA),以及設(shè)計用于檢測單外顯子缺失或重復(fù)的基因靶向微陣列。
臨床特征
臨床描述
PI4KA相關(guān)疾病是一種臨床多變的疾病,其特征是神經(jīng)功能障礙、胃腸道表現(xiàn)(腸閉鎖、炎癥性腸病)和免疫缺陷。發(fā)病通常是產(chǎn)前或兒童早期。已經(jīng)描述了四種重疊的臨床表型:
-
伴有或不伴有炎癥性腸病的具有錐體特征的低髓鞘質(zhì)腦白質(zhì)營養(yǎng)不良,包括下肢痙攣、發(fā)育遲緩和智力障礙。賊常見的介紹;神經(jīng)系統(tǒng)特征通常出現(xiàn)在嬰兒期或兒童早期。
-
嚴重的產(chǎn)前神經(jīng)系統(tǒng)疾病伴關(guān)節(jié)彎曲和腦結(jié)構(gòu)異常(例如,外側(cè)裂多小腦回、小腦發(fā)育不全)
-
出生后不久出現(xiàn)多發(fā)性腸閉鎖,伴有或不伴有免疫缺陷
-
罕見的后發(fā)性純遺傳性痙攣性截癱
迄今為止,已鑒定出 24 名個體患有PI4KA致病性變異 。以下對與這種情況相關(guān)的表型特征的描述基于這些報告。
表 2。
PI4KA 相關(guān)疾病:選擇特征的頻率
1.
在特定臨床體征變得明顯之前死亡的受影響人員不包括在該表中。
神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)
四肢痙攣。迄今為止報告的所有經(jīng)分子證實的 PI4KA相關(guān)疾病的存活超過 1 個月的個體都出現(xiàn)或出現(xiàn)肢體痙攣。除了兩個人之外,這很可能是繼發(fā)于髓鞘質(zhì)白質(zhì)營養(yǎng)不良的所有個體。下肢肌張力亢進和反射活躍比上肢更明顯,有 6 人在檢查時上肢張力正常。肢體痙攣通常是進行性的,導(dǎo)致受影響的個體需要助行器才能行走(如果能夠行走)。
已經(jīng)描述了兩個具有純遺傳性痙攣性截癱表型且發(fā)病較晚(年齡分別為 2 歲和 17 歲)的個體 。
迄今為止,已有 14 人報告發(fā)育遲緩。另外一名個體的粗大運動技能延遲,但語言發(fā)育正常。在報告的 16 名在新生兒期幸存下來的人中,有 9 名在有或沒有支持的情況下實現(xiàn)了行走。五人在考試時沒有表達性語言(考試年齡范圍:3-13 歲),四人會說幾個詞(年齡范圍:5-24 歲),四人語言發(fā)育遲緩,但能夠用多變的句子進行交流長度(年齡范圍:10-13 歲)。
智力障礙 (ID)。在新生兒期幸存的那些人中,除了一個人之外,所有的人都報告了 ID。在這 15 人中,3 人患有輕度 ID,5 人患有中度 ID,7 人患有嚴重 ID。
經(jīng)常報告癲癇發(fā)作;描述了多種癲癇發(fā)作類型(例如,嬰兒痙攣、強直性癲癇發(fā)作、肌陣攣、非典型失神)。癲癇發(fā)作的嚴重程度和對治療的反應(yīng)是可變的。
其他神經(jīng)系統(tǒng)特征包括共濟失調(diào)、眼球震顫、震顫、遠視、肌張力障礙和吞咽困難。六名受影響的人表現(xiàn)出上肢震顫,其中三人被描述為意向性震顫。三個人出現(xiàn)了dysmetria。四人出現(xiàn)肌張力障礙,賊常影響手部。據(jù)報道有四人吞咽困難,兩人輕度,兩人需要胃造口術(shù)。
肌肉骨骼并發(fā)癥包括關(guān)節(jié)彎曲(在 3 名受嚴重影響的個體中報告)、攣縮和脊柱后凸或脊柱側(cè)凸,在 4 名個體中報告。
胃腸道疾病
腸閉鎖是 13 名阿米什新生兒的表現(xiàn)特征(5 名具有PI4KA基因突變p.Tyr1623Asp的分子確認)。閉鎖廣泛并影響從幽門到肛門的胃腸道。只有一個人有足夠的腸管長度可以在初始手術(shù)時嘗試切除,但持續(xù)的炎癥、隨后的再狹窄和新的胃竇閉鎖阻止了腸內(nèi)喂養(yǎng)。在生命的先進個月,所有受影響的新生兒閉鎖的嚴重程度是致命的。受影響腸道切片的組織學(xué)評估顯示腸道炎癥和過多的管腔細胞碎屑,沒有中央管腔的“索狀”腸道切片,以及具有多個相互連接的小管腔的“篩狀”腸道切片。周圍肌壁和神經(jīng)節(jié)細胞正常。在受影響的胎兒中描述的死后組織學(xué)發(fā)現(xiàn)提示上皮器官發(fā)生異常。
炎癥性腸?。↖BD)。IBD表型包括 IBD 未分類、潰瘍性結(jié)腸炎、克羅恩病、可變性全結(jié)腸炎和回結(jié)腸炎癥。發(fā)病年齡從嬰兒期到青年期不等。迄今為止,已在三名患者中報告了 IBD,一名在 6 周時被診斷出患有極早發(fā)性結(jié)腸炎,一名患有嚴重的難治性潰瘍性結(jié)腸炎并在 19 歲時發(fā)病,一名患有依賴類固醇的狹窄型克羅恩病21歲確診。另外一個人患有長期缺鐵性貧血和糞便鈣衛(wèi)蛋白顯著升高,高度提示未確診的炎癥性腸病。據(jù)報道,另有 4 人患有腸功能障礙,但沒有任何額外的臨床細節(jié)。
免疫缺陷。PI4KA相關(guān)疾病的免疫表型仍有待有效闡明,但似乎是一種組合的可變免疫缺陷,包括低丙種球蛋白血癥或無丙種球蛋白血癥和/或白細胞減少癥, Verdura et al 2021]。細胞缺陷的范圍從嚴重的 T 細胞淋巴細胞減少(影響 CD8+ T 細胞多于 CD4+ T 細胞)到中度 B 和 NK 細胞淋巴細胞減少,再到正常的淋巴細胞計數(shù)。免疫球蛋白缺陷的范圍從無丙種球蛋白血癥到影響 IgG 和 IgM(IgA 和 IgE 水平正常)的組合可變免疫缺陷。僅在一名患有多發(fā)性腸閉鎖的嬰兒中進行了全面的免疫表型分析,結(jié)果與TTC7A中所見的聯(lián)合免疫缺陷一致相關(guān)疾病。其他幾個受影響的個體患有低丙種球蛋白血癥,伴有或不伴有淋巴細胞減少和/或反復(fù)感染史。一名患有多發(fā)性腸閉鎖的阿米什新生兒有淋巴細胞減少癥;沒有進行完整的免疫表型分析,孩子在表現(xiàn)出任何免疫缺陷癥狀之前就已經(jīng)死亡。
患有神經(jīng)系統(tǒng)疾病的賊嚴重受影響的活人之一被發(fā)現(xiàn)患有聯(lián)合免疫缺陷,并在 10 歲時發(fā)展為具有成人發(fā)病特征的淋巴瘤:3A 級濾泡性非霍奇金淋巴瘤,具有 bcl6易位且沒有MAP2K1 致病性變異。該個體是PI4KA基因突變p.Asp1854Asn的純合子]。
已在一名個體中描述了自身免疫性中性粒細胞減少癥。
其他
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泌尿生殖系統(tǒng)異常(如腎囊腫、直腸陰道瘺、隱睪、集合系統(tǒng)重復(fù))
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非特異性輕度 畸形特征
-
兩個人描述的聽力損失;確認為感音神經(jīng)
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視力下降、視神經(jīng)萎縮、斜視和/或眼球運動失用
-
一名個體描述的幼年 特發(fā)性關(guān)節(jié)炎(發(fā)病年齡:9 歲 8 個月)]
基因型-表型相關(guān)性
迄今為止,描述為與PI4KA相關(guān)的疾病的個體數(shù)量有限,無法確定確定的表型-基因型相關(guān)性。但是,出現(xiàn)了一些模式:
-
目前, p.Tyr1623Asp基因突變的純合性僅在阿米什血統(tǒng)的個體中被描述,并導(dǎo)致 廣泛多發(fā)性腸閉鎖的一致表型。這些家庭主要選擇姑息治療,所有受影響的新生兒在出生后的先進個月內(nèi)死亡。僅在一名阿米什嬰兒中進行了全面的免疫表型分析,其發(fā)現(xiàn)與聯(lián)合免疫缺陷一致,這讓人聯(lián)想到在 TTC7A相關(guān)疾病中所見的情況。
-
位于 PI4KA 催化 結(jié)構(gòu)域內(nèi) 的 p.Asp1854Asn基因突變在三個反式胎兒中被鑒定 為 無義基因突變 p.Arg796Ter。表 型包括雙側(cè)外側(cè)裂多小腦回、小腦發(fā)育不全、關(guān)節(jié)彎曲和與上皮器官發(fā)生異常一致的胃腸道組織學(xué)。兩個土耳其人 PI4KA純 合子隨后鑒定出基因突變 p.Asp1854Asn;兩者都出現(xiàn)嚴重的神經(jīng)系統(tǒng)疾病和皮質(zhì)腦回異常。功能研究表明,這種基因突變將 PI4KA 的催化功能降低到幾乎無法檢測到的水平 。
患病率
迄今為止,已確定24 名患有PI4KA相關(guān)疾病的個體。
在阿米什社區(qū),致病性基因突變 p.Tyr1623Asp的等位基因頻率為 0.0006。迄今為止,所有已確定的阿米什血統(tǒng)攜帶者都來自俄亥俄州。
遺傳相關(guān)(等位基因)疾病
除本GeneReview中討論的表型外,沒有已知表型與PI4KA中的種系致病變異相關(guān)。
鑒別診斷
PI4KA相關(guān)疾病的鑒別診斷包括兒童早期發(fā)病的低髓鞘質(zhì)腦白質(zhì)營養(yǎng)不良(見表 3中非詳盡的髓鞘質(zhì)腦白質(zhì)營養(yǎng)不良列表)和TTC7A相關(guān)的胃腸道缺陷和免疫缺陷綜合征。
表3。
PI4KA相關(guān)疾病鑒別診斷中的感興趣基因
AR =常染色體隱性遺傳;DiffDx = 鑒別診斷;IBD = 炎癥性腸??;MOI =遺傳方式;XL = X-連鎖
管理
尚未發(fā)表PI4KA相關(guān)疾病的臨床實踐指南。
初步診斷后的評估
為了確定被診斷患有PI4KA相關(guān)疾病的個體的疾病程度和需求,建議進行表 4中總結(jié)的評估(如果未作為導(dǎo)致診斷的評估的一部分進行)。
表 4。
PI4KA 相關(guān)疾病患者初步診斷后的推薦評估
CBC = 全血細胞計數(shù);CRP = C反應(yīng)蛋白;DD = 發(fā)育遲緩;IBD = 炎癥性腸病;ID =智力障礙;MOI =遺傳方式;PT = 物理治療師
1.
醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)家、認證遺傳咨詢師、認證高級遺傳護士
治療表現(xiàn)
建議由包括兒科醫(yī)生、神經(jīng)科醫(yī)生、腸胃科醫(yī)生、臨床遺傳學(xué)家、物理治療師、職業(yè)治療師、語言治療師、眼科醫(yī)生、聽力學(xué)家和初級保健醫(yī)生在內(nèi)的多學(xué)科團隊提供個性化護理。
表 5。
PI4KA 相關(guān)疾病個體表現(xiàn)的治療
ID =智力障礙;HSCT = 造血干細胞移植;OT = 職業(yè)治療;PT = 物理治療
1.
注意:患有 TTC7A相關(guān) MIA 的個體的手術(shù)腸切除術(shù)不會阻止新閉鎖的形成。
2.
由于TTC7A和PI4KA相關(guān)腸病之間的表型和機制重疊,該信息可能適用于PI4KA相關(guān)疾病。
監(jiān)視
迄今為止,尚未制定一般監(jiān)測指南;監(jiān)測應(yīng)個體化。
表 6。
對PI4KA 相關(guān)疾病患者的推薦監(jiān)測
CBC = 全血細胞計數(shù);CRP = C反應(yīng)蛋白;IBD = 炎癥性腸病
評估有風(fēng)險的親屬
有關(guān)為遺傳咨詢目的而對高危親屬進行檢測的相關(guān)問題,請參閱遺傳咨詢。
正在研究的療法
賊近在TTC7A相關(guān)胃腸道缺陷和免疫缺陷綜合征 (OMIM 243150 )的實驗室和動物模型中對抗凋亡藥物的研究表明,來氟米特可能是這種情況下腸道炎癥和狹窄的潛在治療方法 [ Jardine et al 2020 ]。由于TTC7A和PI4KA相關(guān)腸病之間的表型和機制重疊,這種治療可能適用于PI4KA相關(guān)疾病。然而,迄今為止,尚無數(shù)據(jù)支持來氟米特治療PI4KA相關(guān)腸病的功效。
在美國和歐洲的臨床試驗注冊中心搜索ClinicalTrials.gov ,以獲取有關(guān)各種疾病和病癥的臨床研究信息。注意:可能沒有針對這種疾病的臨床試驗。
遺傳咨詢
遺傳咨詢是向個人和家庭提供有關(guān)遺傳疾病的性質(zhì)、遺傳方式和影響的信息,以幫助他們做出明智的醫(yī)療和個人決定的過程。以下部分涉及遺傳風(fēng)險評估以及使用家族史和基因檢測來闡明家庭成員的遺傳狀況;它并非旨在解決可能出現(xiàn)的所有個人、文化或道德問題,或替代與遺傳學(xué)專業(yè)人士的咨詢。—ED。
遺傳方式
PI4KA相關(guān)疾病以常染色體隱性方式遺傳。
對家庭成員的風(fēng)險
先證者的父母
-
受影響個體的父母被認為是 PI4KA 致病性變異的雜合子。
-
建議先證者 的父母進行分子遺傳學(xué)檢測, 以確認父母雙方都是 PI4KA致病性變異的雜合子, 并允許進行高效的 反復(fù)風(fēng)險評估。如果僅在一個父母中檢測到致病變異,并且父母身份測試已確認生物學(xué)父子關(guān)系,則應(yīng)考慮以下可能性:
-
在先證者中鑒定出的致病變異之一是 先證者的 新生事件或 馬賽克父母的合子后新生事件。
-
具有 致病性變異 的親本 染色體的單親同源性導(dǎo)致 先證者的致病性變異純合。
-
-
雜合子(攜帶者)是無癥狀的,沒有患上這種疾病的風(fēng)險。
先證者的同胞
-
如果已知父母雙方都是 PI4KA致病性變異的雜合子, 則受影響個體的每個同胞在受孕時有 25% 的機會受到影響,有 50% 的機會成為無癥狀 攜帶者,并且有 25% 的機會不遺傳任何一個家族 性致病變異。
-
雜合子(攜帶者)是無癥狀的,沒有患上這種疾病的風(fēng)險。
先證者的后代。除非受影響個體的生殖伴侶也患有PI4KA相關(guān)疾病或者是攜帶者,否則后代將是PI4KA致病性變異的專性雜合子(攜帶者) 。(注:在阿米什社區(qū)中,致病性基因突變p.Tyr1623Asp的等位基因頻率為 0.0006。)
其他家庭成員。先證者父母的每個同胞都有50% 的風(fēng)險成為PI4KA致病性變異的攜帶者。
載波檢測
對有風(fēng)險的親屬進行攜帶者檢測需要事先確定家族中的PI4KA致病變異。
相關(guān)遺傳咨詢問題
家庭計劃
-
確定遺傳風(fēng)險和討論產(chǎn)前/ 植入前基因檢測可用性的賊佳時間是在懷孕前。
-
向攜帶者或有攜帶者風(fēng)險的年輕人 提供 遺傳咨詢(包括討論對后代的潛在風(fēng)險和生殖選擇)是適當?shù)摹?/span>
產(chǎn)前檢測和胚胎植入前基因檢測
一旦在受影響的家庭成員中鑒定出PI4KA致病變異,就可以進行產(chǎn)前和植入前基因檢測。
對于產(chǎn)前檢查的使用,醫(yī)療專業(yè)人員和家庭內(nèi)部可能存在觀點差異。雖然大多數(shù)中心將使用產(chǎn)前檢測視為個人決定,但討論這些問題可能會有所幫助。
資源
人體基因序列變化與人體疾病表征 工作人員選擇了以下特定疾病和/或傘式支持組織和/或登記處,以造?;加羞@種疾病的個人及其家人。人體基因序列變化與人體疾病表征 不對其他組織提供的信息負責(zé)。有關(guān)選擇標準的信息,請在本文上方的搜索框中搜索查詢。
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美國智力和發(fā)育障礙協(xié)會 (AAIDD)
電話: 202-387-1968
傳真: 202-387-2193
www.aaidd.org -
醫(yī)療之家門戶
白細胞營養(yǎng)不良 -
醫(yī)學(xué)在線加
智力殘疾 -
國家神經(jīng)疾病和中風(fēng)研究所 (NINDS)
電話: 800-352-9424
遺傳性痙攣性截癱信息頁面
分子遺傳學(xué)
分子遺傳學(xué)和 OMIM 表中的信息可能與 GeneReview 中其他地方的信息不同:表中可能包含更新的信息。—教育署。
表 A。
PI4KA 相關(guān)疾?。夯蚝蛿?shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)來自以下標準參考文獻:來自HGNC的基因;來自OMIM的染色體基因座;來自UniProt的蛋白質(zhì)。有關(guān)提供鏈接的數(shù)據(jù)庫(Locus Specific、HGMD、ClinVar)的描述,請在本文上方的搜索框中搜索查詢。
表 B。
PI4KA 相關(guān)疾病的 OMIM 條目(在 OMIM 中查看全部)
分子發(fā)病機制
PI4KA編碼激酶蛋白磷脂酰肌醇 4-激酶 α (PI4KIIIα),它普遍表達并且對于下游磷脂酰肌醇的產(chǎn)生是必不可少的。磷脂酰肌醇(特別是 4-磷酸磷脂酰肌醇、4,5-二磷酸磷脂酰肌醇和 3,4,5-三磷酸磷脂酰肌醇)在質(zhì)膜和其他細胞器中發(fā)揮基本的信號傳導(dǎo)作用,并在維持細胞膜完整性方面發(fā)揮關(guān)鍵作用。
PI4KIIIα 的功能取決于功能性 C 端催化結(jié)構(gòu)域以及與 TTC7A 或 TTC7B 和 FAM126A 形成異源三聚體復(fù)合物以維持 PI4KIIIα 穩(wěn)定性的能力。然后復(fù)合物通過另一種蛋白質(zhì) EFR3 定位到細胞膜上。
TTC7A 和 TTC7B 復(fù)合物的分布因組織類型而異。含 TTC7A 的復(fù)合物在胃腸道組織中更為普遍,而含 TTC7B 的復(fù)合物在神經(jīng)組織中更為普遍。由于 PI4KIIIα 與 TTC7A 或 TTC7B 之間結(jié)合位點的差異,PI4KA基因突變可能會以不同方式影響這兩種復(fù)合物,從而影響相應(yīng)的組織,從而導(dǎo)致主要是胃腸道或神經(jīng)系統(tǒng)表型。
與阿米什社區(qū)的致病性基因突變相關(guān)的神經(jīng)學(xué)表型可以通過其對 PI4KIIIα 與 TTC7A 形成復(fù)合物的能力和接近正常的催化活性的影響來解釋 。
發(fā)病機制。 PI4KA致病變異可能通過以下機制之一引起疾?。?/span>
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無義介導(dǎo)的 mRNA衰變和功能蛋白的丟失
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由于影響催化結(jié)構(gòu)域 的基因突變導(dǎo)致 PI4KIIIα 催化活性喪失
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由于無法與 TTC7A 或 TTC7B 和 FAM126A 形成復(fù)合物而導(dǎo)致蛋白質(zhì)穩(wěn)定性喪失